Novità
- 135 nuovi pokemon per un nuovo totale di 386
- Nuova grafica
- Nuovi effetti sonori
- Distinzione tra Bici da Corsa e Bici da Cross
- Lotte in doppio (2 Vs 2)
- PokeNav
- Nuovi luoghi (per la prima volta Hoenn)
- Nuova MN, la n° 8, Sub (per la prima volta si possono esplorare i fondali marini)
- Gare Pokemon (non le lotte, delle gare di clase, bellezza, ecc.)
- PokeMelle (caramelle utili per aumentare le abilità in gara ottenute dalle bacche)
- Scarpe da Corsa
- Basi segrete (la MT Forzasegreta si può utilizzare anche fuori dalla lotta per scavare le basi)
- "Dono segreto" diventa "Evento segreto"
Differenze
| Rubino | Zaffiro |
| Team Magma | Team Idro |
| Dopo la Lega, puoi trovare Latios (#197) | Dopo la Lega. puoi trovare Latias (#196) |
| Seedot, Nuzleaf, Shiftry, Mawile, Zangoose, Solrock, Groudon | Lotad, Lombre, Ludicolo, Sableye, Seviper, Lunatone, Kyogre |
| Dopo aver svegliato Groudon, ci sarà Siccità | Dopo aver svegliato Kyogre, sarà Piovoso |
| Puoi ricevere la Tenda Rossa per la base segreta | Puoi ricevere la Tenda Blu per la base segreta |
| Sul Monte Pira c'è la Sfera Rossa | Sul Monte Pira c'è la Sfera Blu |
